В 1871 году, по ходатайству крестьян села, на деньги, пожертвованные жителем деревни Алёшино А.Н.Прибытковым, в селе Кубенском была открыта церковно-приходская школа. Это было мужское земское двухклассное училище. В 1910 году двухклассное училище преобразовано в высшее начальное училище с ремесленным отделением по слесарному и кузнечному ремеслу. В нём обучалось 123 ученика, из них 117 мальчиков и 6 девочек. После революции в 1920 году – это школа второй ступени, вскоре преобразованная в среднюю. В 1937 году состоялся 1 выпуск учащихся Кубенской средней школы – 14 учеников. Это был первый выпуск в районе. А потом была война. Из выпуска 1941 года (было 3 класса) это около 90 человек. Многие из ребят и девчат ушли на фронт. В марте 42 пришли первые похоронки на Валю Мохова и Веню Зеляева. Кто остался в селе, тех отправляли на окопы.
А школа жила своей жизнью, 1 сентября 1941 г. вновь школьный звонок позвал ребят на первый урок. А после уроков ребята помогали на полях колхоза «Путь к коммунизму». Была создана школьная бригада, которая занималась прополкой полей семенной пшеницы, косили, сушили, стоговали сами ребята. Зимой собирали золу и возили на поля, заготовляли хвою. По призыву Несвойских ребят, Кубенские пионеры заработали 1207 рублей на строительство самолёта для фронта. Тяжело было, но как вспоминают ученики военного времени, всё это закалило их физически и морально. Из 17 выпускников 45 года 15 поступили в институты: Московский авиационный, Ленинградский медицинский, 5- Вологодский пединститут, Ленинградский технический, военные училища, МГУ и т.д.в 1955 год при активном участии школьников и учителей, во главе с директором Якоревым Анатолием Васильевичем, было построено каменное здание теперь уже старой школы, но для всех, кто там учился, родное. Но по - прежнему школа размещалась в 7 зданиях, и учителя вынуждены были бегать из здания в здание на уроки. В 1958 году общеобразовательная школа была преобразована в школу с производственным обучением. 1972 год в селе построено новое типовое здание школы.
